Inom sjukvården används HBOT vid ett begränsat antal tillstånd där evidensen bedöms starkast.
De som oftast återkommer i internationella riktlinjer är dykarsjuka, luftemboli och kolmonoxidförgiftning. Där är behandlingen förstahandsval och tidsfaktorn avgörande.
Därutöver förekommer HBOT vid strålskadad vävnad efter cancerbehandling, vissa allvarliga mjukdelsinfektioner, svårläkta sår och i vissa fall plötslig hörselnedsättning.
Exakt vilka indikationer som accepteras skiljer sig mellan länder. Det som är rutin i ett land kan vara undantag i ett annat, vilket gör att listor på nätet ofta motsäger varandra.